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從預(yù)制的入GTll文庫(kù)中制備cDNA插入片段

更新時(shí)間:2013-03-12點(diǎn)擊次數(shù):1635

[方法]
A.PCR擴(kuò)增cDNA插入片段
1.在冰浴中將以下成分加到0.2m1微量離心管中(執(zhí)行10步反應(yīng))
● 水,36.5ul
● 10×Pfu緩沖液,5.0ul
● 10mmol/L dNTP, 1.5ul
● λGTll正向引物 (10umol/L),2.5ul
● λGTll反向引物(10umol/L),2.5ul
● 已制備好的Sfi-NotIλGTll cDNA文庫(kù),1.Oul
● PfuDNA聚合酶(2.5U/ul),1.0ul
2.混合反應(yīng)物并用50ul的礦物油覆蓋。
3.在95℃下使模板變性2分鐘,按如下操作執(zhí)行25次循環(huán): (a)95℃變性1分鐘; (b)50℃退火1分鐘;(c)72℃延伸3分鐘(zui后一輪的延伸時(shí)間增加到7分鐘)。
B.純化并用限制性?xún)?nèi)切酶消化擴(kuò)增的cDNA1.純化在A部分中用QIAquick PCR擴(kuò)增儀器得到了PCR產(chǎn)物,每?jī)蓚€(gè)PCR反應(yīng)用一個(gè)旋轉(zhuǎn)柱并在30ul的水中提取純化的PCR產(chǎn)物。
2.收集提取的PCR產(chǎn)物,如下所示建立限制性消化:
● 水,25ul
● 純化的PCR產(chǎn)物,150ul
● 10X限制性?xún)?nèi)切酶緩沖液,20ul
● 限制性?xún)?nèi)切酶(10U/ul),5ul
3.在適當(dāng)?shù)臏囟认?小時(shí)。
C.對(duì)擴(kuò)增和消化的cDNA按大小進(jìn)行分餾并重新獲得cDNA1.在0.8%(w/v)瓊脂糖/TAE凝膠(允許電壓為1~5V/cm)上純化限制酶的消化產(chǎn)物。
2.用無(wú)菌刀小心地切除靶區(qū)域(500~3000bp),將凝膠片轉(zhuǎn)移到15ml的聚丙烯管中。注意:增加了跑膠時(shí)間會(huì)導(dǎo)致靶區(qū)域的擴(kuò)大。
3.用Geneclean或WizardPCRDNA預(yù)純化系統(tǒng)來(lái)純化瓊脂糖凝膠分離的片段,在50ul的水中重新得到擴(kuò)增的cDNA。
4.用DNA濃度測(cè)量試劑盒來(lái)估計(jì)DNA的濃度。

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